支出性質
從支出性質分類，專項資金包括個人部分（如：專項補貼、專項獎勵等）和公用部分（如：專項購置、專項修繕等）；
支出用途
從支出用途分類，可以將專項資金分為基本建設支出、專項業務費、專項支出購置、專項修繕和其他專項等。
在財政部印發的《中央本級項目支出預算管理辦法》中規定，項目支出預算是在基本支出預算之外編制的年度項目支出計劃（或專項資金支出計劃）。項目按照其性質可以分為基本建設類項目、行政事業類項目和其他類項目。對于地方而言，專項資金分類與中央項目支出分類基本一致，只是在資金來源和使用方面存在一些差別。地方專項資金來源主要是地方財政部門安排的預算內資金、預算外資金、上級補助或上級撥款的資金、政府性基金及轉移支付資金等；地方專項資金的使用主要是地方政府承擔的基礎設施建設和發展及其他專項事業支出等。
