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根據(jù)《關(guān)于印發(fā)〈關(guān)于個人獨資企業(yè)和合伙企業(yè)投資者征收個人所得稅的規(guī)定〉的通知》（財稅〔2000〕91號）和《財政部 國家稅務(wù)總局關(guān)于調(diào)整個體工商戶、個人獨資企業(yè)和合伙企業(yè)個人所得稅稅前扣除標準有關(guān)問題的通知》（財稅〔2008〕65號）、《財政部 國家稅務(wù)總局關(guān)于調(diào)整個體工商戶業(yè)主 個人獨資企業(yè)和合伙企業(yè)自然人投資者個人所得稅費用扣除標準的通知》(財稅〔2011〕62號)的規(guī)定，現(xiàn)將個人獨資企業(yè)和合伙企業(yè)個人所得稅年度申報和匯算清繳相關(guān)政策指引整理如下，以供納稅人參照學(xué)習。 

一、稅率 
       實行查賬征稅辦法的，其稅率比照個人所得稅法的“個體工商戶的生產(chǎn)經(jīng)營所得”應(yīng)稅項目，適用5%-35%的五級超額累進稅率，計算征收個人所得稅。實行核定征收方式的，先按照應(yīng)稅所得率計算其應(yīng)納稅所得額，再按其應(yīng)納稅所得額的大小，適用5%-35%的五級超額累進稅率，計算征收個人所得稅。 
投資者興辦兩個或兩個以上企業(yè)的（包括參與興辦），年度終了時，應(yīng)匯總從所有企業(yè)取得的應(yīng)納稅所得額，據(jù)此確定適用稅率并計算繳納個人所得稅。 

二、查賬征收應(yīng)納個人所得稅的計算 
個人獨資企業(yè)和合伙企業(yè)應(yīng)納稅所得額，等于每一納稅年度的收入總額減除成本、費用以及損失后的余額，作為投資者個人生產(chǎn)經(jīng)營所得， 
    （一）收入總額 
      收人總額是指企業(yè)從事生產(chǎn)經(jīng)營以及與生產(chǎn)經(jīng)營有關(guān)的活動所取得的各項收入，包括商品（產(chǎn)品）銷售收入、營運收入、勞務(wù)服務(wù)收入、工程價款收入、財產(chǎn)出租或轉(zhuǎn)讓收入、利息收入、其他業(yè)務(wù)收入和營運業(yè)外收入。 
    （二）扣除項目 
      扣除項目比照《個體工商戶個人所得稅計稅辦法（試行）》（國稅發(fā)〔1997〕43號）的規(guī)定確定，但下列項目的扣除依照以下規(guī)定執(zhí)行： 
      1、從2011年9月1日起，投資者的費用扣除標準為每月3500元。投資者興辦兩個或兩個以上企業(yè)的，費用扣除標準由投資者選擇在其中一個企業(yè)的生產(chǎn)經(jīng)營所得中扣除。投資者的工資不得在稅前扣除。
      2、個人獨資企業(yè)和合伙企業(yè)向其從業(yè)人員實際支付的合理的工資、薪金支出，允許在稅前據(jù)實扣除。 
      3、個人獨資企業(yè)和合伙企業(yè)撥繳的工會經(jīng)費、發(fā)生的職工福利費、職工教育經(jīng)費支出分別在工資薪金總額2%、14%、2.5%的標準內(nèi)據(jù)實扣除。 
      4、個人獨資企業(yè)和合伙企業(yè)每一納稅年度發(fā)生的廣告費和業(yè)務(wù)宣傳費用不超過當年銷售（營業(yè)）收入15%的部分，可據(jù)實扣除；超過部分，準予在以后納稅年度結(jié)轉(zhuǎn)扣除。 
      5、個人獨資企業(yè)和合伙企業(yè)每一納稅年度發(fā)生的與其生產(chǎn)經(jīng)營業(yè)務(wù)直接相關(guān)的業(yè)務(wù)招待費支出，按照發(fā)生額的60%扣除，但最高不得超過當年銷售（營業(yè)）收入的5‰。 
      6、投資者及其家庭發(fā)生的生活費用不允許在稅前扣除。投資者及其家庭發(fā)生的生活費用與企業(yè)生產(chǎn)經(jīng)營費用混合在一起，并且難以劃分的，全部視為投資者個人及家庭發(fā)生的生活費用，不允許在稅前扣除。 
      7、企業(yè)計提的各種準備金不得稅前扣除。
    （三）虧損彌補 
      1、企業(yè)的年度虧損，允許用本企業(yè)下一年度的生產(chǎn)經(jīng)營所得彌補，下一年度所得不足彌補的，允許逐年延續(xù)彌補，但最長不得超過5年。 
      2、投資者興辦兩個或兩個以上企業(yè)的，企業(yè)的年度經(jīng)營虧損不能跨企業(yè)彌補。 
      3、實行查賬征稅方式的個人獨資企業(yè)和合伙企業(yè)改為核定征收方式后，在查賬征稅方式下認定的年度經(jīng)營虧損未彌補完的部分，不得再繼續(xù)彌補。 
    （四）對外投資分回的利息或者股息、紅利 
個人獨資企業(yè)對外投資分回的利息或者股息、紅利，不并入企業(yè)的收入，而應(yīng)單獨作為投資者個人取得的利息、股息、紅利所得，按“利息、股息、紅利所得”應(yīng)稅項目計算繳納個人所得稅。以合伙企業(yè)名義對外投資分回利息或者股息、紅利的，應(yīng)按比例確定各個投資者的利息、股息、紅利所得，分別按“利息、股息、紅利所得”應(yīng)稅項目計算繳納個人所得稅。 
三、投資者興辦兩個或兩個以上企業(yè)應(yīng)納稅額的計算辦法 
個人投資兩個或兩個以上獨資、合伙企業(yè)的，投資者個人應(yīng)分別向企業(yè)實際經(jīng)營管理所在地主管稅務(wù)機關(guān)預(yù)繳個人所得稅，年度終了后3個月內(nèi)辦理匯算清繳，區(qū)別以下不同情況分別處理，將企業(yè)的經(jīng)營所得合并計算應(yīng)納稅額，多退少補。
    （1）投資者興辦的企業(yè)全部是個人獨資企業(yè)的，分別向各企業(yè)實際經(jīng)營管理所在地稅務(wù)部門辦理年度納稅申報，并依其投資的全部個人獨資企業(yè)的經(jīng)營所得確定適用稅率，以本企業(yè)實際生產(chǎn)經(jīng)營所得為基礎(chǔ)，計算應(yīng)繳稅款，辦理匯算清繳。計算公式為： 
應(yīng)納稅所得額＝各個獨資企業(yè)應(yīng)納稅所得額的合計數(shù) 
應(yīng)納個人所得稅稅額＝應(yīng)納稅所得額×適用稅率－速算扣除數(shù) 本企業(yè)投資者應(yīng)納稅額＝應(yīng)納個人所得稅稅額×（本企業(yè)應(yīng)納稅所得額÷各個獨資企業(yè)應(yīng)納稅所得額的合計數(shù)） 
本企業(yè)投資者應(yīng)補繳個人所得稅稅額=本企業(yè)投資者應(yīng)納個人所得稅稅額－本企業(yè)投資者預(yù)繳個人所得稅稅額 
    （2）投資者興辦企業(yè)中有合伙企業(yè)的，將投資者在合伙企業(yè)中應(yīng)分配的應(yīng)納稅所得額與其投資于獨資企業(yè)的應(yīng)納稅所得額合并，確定應(yīng)納個人所得稅稅額。投資者應(yīng)向經(jīng)常居住地稅務(wù)主管稅務(wù)機關(guān)申報納稅，辦理匯算清繳；對于經(jīng)常居住地與其興辦企業(yè)的經(jīng)營管理所在地不一致的，應(yīng)由納稅人選定其參與興辦的某一合伙企業(yè)經(jīng)營管理所在地辦理匯算清繳，并且在5年內(nèi)不得變更。5年以后需要變更的，或者匯繳企業(yè)所在地的所辦企業(yè)停止經(jīng)營的，投資者可向主管稅務(wù)機關(guān)申請變更匯繳地點。計算公式為： 
應(yīng)納稅所得額＝投資者從各個企業(yè)分得的經(jīng)營所得之和 應(yīng)納稅額＝應(yīng)納稅所得額×稅率－速算扣除數(shù) 
投資者應(yīng)補繳的稅額＝應(yīng)納稅額－投資者各個企業(yè)預(yù)繳的稅額之和